(==>)markus:
Kommt auf die Daten drauf an, hat man ascii-files oder kann das als solche exportieren, dann können selbst Tabellenkalkulationsprogramme 2D-Graphen ("Bilder") erstellen.
Etwas komplizierter, weil Konsole, aber mit enorm vielen Möglichkeiten ist Matlab. Da gibts auch einen Freeware-Klon, Octave, der Gnu-Plot nutz, aber von der Bedienung her gleich ist. Ich nutze Octave viel und gerne, das importieren geht ohne große Probleme und Standardaufgaben können per Skript erledigt werden.